來(lái)源:《光明日?qǐng)?bào)》
記者易運(yùn)文14日獲悉,香港中文大學(xué)、華大基因研究院、農(nóng)業(yè)部、中國(guó)科學(xué)院等單位合作的“大豆回家”項(xiàng)目,在大豆基因組研究取得重大突破。研究成果“31個(gè)大豆基因組重測(cè)序揭示遺傳多樣性和進(jìn)化選擇模式”在國(guó)際著名雜志《自然?遺傳學(xué)》上在線發(fā)表。該研究首次對(duì)野生大豆和栽培大豆全基因組進(jìn)行了大規(guī)模遺傳多態(tài)性分析,為全球大豆的遺傳學(xué)研究提供了非常有價(jià)值的資源,為大豆種質(zhì)資源保護(hù)和分子育種帶來(lái)新的科學(xué)啟示。
研究人員運(yùn)用新一代測(cè)序技術(shù)對(duì)17株野生大豆和14株栽培大豆進(jìn)行了全基因組重測(cè)序,利用SOAP軟件v2.18比對(duì)到大豆的參考基因組上,總共發(fā)現(xiàn)了630多萬(wàn)個(gè)單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)(SNPs),建立了高密度的分子標(biāo)記圖譜。同時(shí)通過(guò)SOAP-denovo軟件分別對(duì)野生大豆和栽培大豆進(jìn)行組裝,從而鑒定出了18萬(wàn)多個(gè)兩種大豆中獲得和缺失變異(PAVs),得到了在栽培大豆中獲得以及丟失的基因。(記者 易運(yùn)文)