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接近完整:高質量白菜基因組圖譜發(fā)布

放大字體  縮小字體 發(fā)布日期:2023-02-28  來源:中國科學報 2023年2月17日  作者:李晨 陳旭  瀏覽次數(shù):866
 
  近日,中國農業(yè)科學院蔬菜花卉研究所分子育種創(chuàng)新團隊研究獲得接近完整組裝的白菜基因組,揭示白菜著絲粒的快速進化特征。相關研究成果在線發(fā)表于《植物生物技術》(Plant Biotechnology Journal)。
 

大白菜       中國農科院供圖
 
  白菜是世界上栽培歷史最悠久的蔬菜作物之一,是我國栽培面積最大的葉用蔬菜。作為蕓薹屬作物中第一個完成基因組測序的物種,白菜參考基因組為白菜作物的基因組研究和遺傳改良奠定重要基礎。但是,目前的白菜參考基因組仍然存在幾百個缺口,其10條染色體的著絲粒結構組裝均不完整。
 
  該團隊利用三代測序技術,獲得接近完整的白菜基因組。該基因組填補了白菜基因組中絕大多數(shù)缺口,完成了8條染色體從端粒到端粒的完整組裝,僅有2條染色體仍存在一個缺口。該基因組是目前組裝最為完整的白菜基因組。
 
  進一步研究發(fā)現(xiàn),著絲粒區(qū)域長末端重復序列的平均插入時間為14萬年,顯著晚于泛著絲粒區(qū)域,表明白菜的著絲粒區(qū)域經歷著快速進化。
 
  該研究得到國家重點研發(fā)計劃、中國農業(yè)科學院科技創(chuàng)新工程項目等項目的支持。
 
  相關論文信息:https://doi.org/10.1111/pbi.14015
 
 
 
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