隨著科技的發(fā)展，分子生物學、基因組學等在育種中使用的越來越廣泛。近日，一個小麥基因定位與基因組研究平臺—WheatGmap構(gòu)建成功，該平臺由中國農(nóng)科院作科所小麥基因資源發(fā)掘與利用創(chuàng)新團隊牽頭構(gòu)建。據(jù)介紹，這一成果為高效克隆小麥功能基因提供了一個有效的數(shù)據(jù)利用、分析和共享平臺。相關(guān)研究成果在線發(fā)表于《分子植物（Molecular Plant）》。

 

 

WheatGmap頁面。網(wǎng)絡(luò)截圖

 

　　據(jù)團隊科學家孔秀英研究員介紹，集群分離分析作為一種在分離群體中鑒定目標基因的方法，由于具有高效、低成本的優(yōu)點被廣泛應(yīng)用。然而，對于缺乏生物信息學背景的研究者來說，如何才能深度分析高通量測序獲得的數(shù)據(jù)、正確選擇最優(yōu)算法、有效利用已公布的海量數(shù)據(jù)？這成為限制當前應(yīng)用集群分離分析方法進行小麥基因快速定位和候選基因篩選的問題。因此，研發(fā)一個界面友好、易操作的專業(yè)性數(shù)據(jù)處理平臺，對推動小麥研究有重要的應(yīng)用意義。

 

　　據(jù)介紹，該平臺目前整合并分析了超過3500份六倍體小麥的高通量測序數(shù)據(jù)，包括全基因組測序(WGS)、外顯子組測序(WES)和轉(zhuǎn)錄組測序(RNA-seq)數(shù)據(jù)。為了方便用戶利用這些資源，網(wǎng)站整合了四種集群分離分析模型，還集成了序列比對、基因注釋、表達分析、富集分析等序列分析和基因功能研究常用的工具?？梢詭椭蒲泄ぷ髡呃眉悍蛛x分析方法進行小麥基因定位、克隆與功能研究，也可以共享測序數(shù)據(jù)及表型數(shù)據(jù)。

 

　　同時，隨著泛基因組時代的來臨，團隊后續(xù)還會對平臺進行數(shù)據(jù)更新與升級，使其功能變得更強大。

 

　　WheatGmap頁面研究得到國家重點研發(fā)計劃、中國農(nóng)科院科技創(chuàng)新工程和國家自然科學基金等支持。