本報訊(記者 李麗穎)西瓜甜瓜是如何變甜的?這個謎底終于被我國科學家解開了!北京時間11月2日零點,《自然-遺傳學》以兩篇長文形式在線發(fā)表了兩項由我國科學家主導的瓜類作物基因組研究成果,并同時刊發(fā)了相應的專評和社評。兩項研究分別構(gòu)建了甜瓜和西瓜的全基因組變異圖譜,揭示了兩種水果的馴化歷史及果實品質(zhì)的遺傳分子機制。據(jù)介紹,上述兩項研究是中國農(nóng)科院鄭州果樹研究所、北京農(nóng)林科學院及深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所協(xié)同創(chuàng)新的成果。
中國農(nóng)科院鄭州果樹研究所研究員徐永陽介紹,其所在團隊聯(lián)合中國農(nóng)科院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所、西班牙巴塞羅那基因組中心及中國農(nóng)科院蔬菜花卉研究所、青島農(nóng)業(yè)大學、中國農(nóng)業(yè)大學、美國康奈爾大學、法國農(nóng)業(yè)科學院等19個國內(nèi)外科研機構(gòu),歷時5年,共同構(gòu)建了世界第一個甜瓜全基因組變異圖譜,首次系統(tǒng)闡釋了甜瓜的復雜馴化歷史及重要農(nóng)藝性狀形成的遺傳基礎。
甜瓜研究團隊分析了千余份甜瓜種質(zhì)資源的基因組變異,共鑒定了560萬個SNP(單核苷酸多態(tài)性)。在此基礎上,發(fā)現(xiàn)甜瓜可能發(fā)生過三次獨立的馴化事件,其中一次發(fā)生在非洲地區(qū),另外兩次發(fā)生在亞洲地區(qū)并分別產(chǎn)生了厚皮甜瓜和薄皮甜瓜兩個栽培亞種。三次獨立馴化“異曲同工”,都導致野生甜瓜失去了苦味和酸味并獲得了甜味。此外,通過全基因組關(guān)聯(lián)分析等手段,定位了200余個與甜瓜苦味、酸味、果實大小、果肉顏色等性狀相關(guān)的候選基因和位點。
北京市農(nóng)林科學院許勇團隊、中國農(nóng)科院鄭州果樹所劉文革團隊、美國康奈爾大學BoyceThompson研究所費章君團隊和中國農(nóng)科院深圳基因組所黃三文團隊等組成聯(lián)合攻關(guān)團隊,采用單分子測序、光學圖譜與Hi-C三維基因組聯(lián)合分析,完成了全新一代西瓜基因組高質(zhì)量精細圖譜繪制。這是迄今為止最高質(zhì)量的西瓜基因組序列圖譜。
西瓜攻關(guān)團隊繼而對400多份種質(zhì)資源開展了基因組變異分析,共鑒定近2000萬個SNP。在此基礎上,首次明確了西瓜7個種之間的進化關(guān)系,發(fā)現(xiàn)野生黏籽西瓜是距現(xiàn)代栽培西瓜親緣關(guān)系最近的種群,也發(fā)現(xiàn)了利用野生西瓜進行抗性改良的基因組痕跡。此外,鑒定獲得了與果實含糖量、瓤色、形狀等性狀關(guān)聯(lián)的43個信號位點,提供了關(guān)鍵候選基因。