日前,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所王曉武科研團隊與浙江大學(xué)張明芳研究團隊聯(lián)合完成了芥菜和黑芥基因組測序與序列解析,相關(guān)研究成果近期在線發(fā)表于《自然.遺傳(Nature Genetics)》上。
芥菜屬于蕓薹屬的一類重要蔬菜,包括榨菜、大頭菜、雪里蕻等。芥菜由蕓薹屬的兩個二倍體基本種白菜(A基因組)和黑芥(B基因組)通過雜交和基因組加倍形成,屬于異源四倍體基因組(AABB)。通過測序分析,確定了芥菜的A基因組來源,揭示了芥菜多倍體基因組上同源基因的表達與選擇機制。發(fā)現(xiàn)顯著差異表達的同源基因具有更快的進化速率,且芥菜中菜用和油用類群的分化與同源基因差異表達相關(guān),表明同源基因差異表達對多倍體演化起著重要作用。
在該研究中,王曉武團隊負(fù)責(zé)完成了黑芥B基因組的測序,以及芥菜(AABB)和油菜(AACC)這兩個異源四倍體A基因組來源分析的工作;分析發(fā)現(xiàn),芥菜和油菜的A基因組來源不同,芥菜(AABB)的A基因組來源于白菜型油菜,油菜(AACC,C為甘藍(lán))的A基因組起源于歐洲蕪菁。
芥菜和黑芥基因組的測序分析,將為蕓薹屬作物的系統(tǒng)比較研究提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù),為芥菜類作物的優(yōu)異基因資源挖掘和農(nóng)藝性狀改良打下基礎(chǔ)。該研究是多個團隊聯(lián)合研究取得的一項重要成果,王曉武、程鋒是論文的并列第一作者。(通訊員 李海芬)
論文鏈接:http://www.nature.com/ng/journal/vaop/ncurrent/full/ng.3657.html