人民網(wǎng)北京10月13日電 (記者 魏艷)在番茄商品化育種中,由于強(qiáng)調(diào)追求高產(chǎn)和耐儲運等商業(yè)品質(zhì),番茄風(fēng)味品質(zhì)下降了,消費者抱怨番茄的味道越來越淡了。近日,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉所研究員、深圳農(nóng)業(yè)基因組所副所長黃三文領(lǐng)導(dǎo)研究團(tuán)隊,通過對世界各地的360份番茄種質(zhì)進(jìn)行了重測序分析,構(gòu)建了完整的番茄遺傳變異組圖譜,為培育更加美味的番茄提供新的工具。
番茄起源于南美洲的安第斯山脈,在隨后的幾百年中番茄被傳播到世界各地,如今已成為品種多樣、世界各地普遍種植的第一大蔬菜作物。據(jù)聯(lián)合國糧農(nóng)組織統(tǒng)計,全球番茄的總產(chǎn)值為550億美元。在番茄變異組大數(shù)據(jù)的基礎(chǔ)上,黃三文團(tuán)隊正和美國科學(xué)院院士Harry Klee 教授領(lǐng)導(dǎo)的番茄品質(zhì)育種團(tuán)隊緊密合作,將闡明影響番茄風(fēng)味的20多種揮發(fā)性物質(zhì)的代謝和積累的機(jī)理,為培育更加美味的番茄提供新的工具。
此外,通過群體遺傳學(xué)分析,該研究還揭示了番茄果實變大經(jīng)歷了從醋栗番茄到櫻桃番茄再到大果栽培番茄的兩次進(jìn)化過程,在此過程中分別有5個和13個果實重量基因受到了人類的定向選擇。
研究團(tuán)隊通過比較不同番茄群體的基因組差異,發(fā)現(xiàn)第5號染色體是決定鮮食番茄和加工番茄(主要用于生產(chǎn)番茄醬)差異的主要基因組區(qū)域,此區(qū)域含有多個控制番茄可溶性固形物和果實硬度的基因,這些基因賦予了加工番茄顯著的特征。此外,通過全基因組關(guān)聯(lián)分析,發(fā)現(xiàn)了決定粉果果皮顏色的關(guān)鍵變異位點,此位點的變異導(dǎo)致SlMYB12基因啟動子區(qū)域的缺失,進(jìn)而影響該基因的表達(dá),從而使得成熟的粉果番茄果皮中不能積累類黃酮。我國北方消費者偏好粉果番茄,這一發(fā)現(xiàn)為培育粉果番茄品種提供了有效的分子育種工具。
通過比較基因組學(xué),研究團(tuán)隊準(zhǔn)確地界定了野生番茄基因組片段在栽培番茄基因組中的位置和長度。分析發(fā)現(xiàn),番茄的馴化和野生資源的利用共導(dǎo)致了約25%(約2億個堿基)的基因組區(qū)域被固定,這嚴(yán)重限制了番茄的進(jìn)一步改良。有了變異組提供的1100多萬個分子標(biāo)記,今后育種有可能突破這一限制,進(jìn)一步拓展番茄育種的空間。
最新研究成果以長篇幅論文在線發(fā)表于10月13日的《Nature Genetics(自然·遺傳學(xué))》雜志。該研究是繼2012年《Nature》發(fā)表番茄全基因組序列圖后取得的另一重要成果,也是中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所功能基因組創(chuàng)新團(tuán)隊近年來在《Nature》、《Nature Genetics》、《PNAS》、《PLoS Genetics》等刊物上發(fā)表多篇研究論文后,又一次在國際知名雜志發(fā)表的重要研究成果。蔬菜所所長杜永臣認(rèn)為必須借助基因組學(xué)研究,努力提高我國蔬菜育種的核心競爭力,促進(jìn)民族種業(yè)的跨越性發(fā)展。
本研究得到了國家“973”計劃、國家杰出青年科學(xué)基金、“863”計劃、農(nóng)業(yè)部和中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技創(chuàng)新工程等項目的資助。