原標(biāo)題:我科學(xué)家主導(dǎo)完成甘藍(lán)基因組測(cè)序和分析
科技日?qǐng)?bào)訊 (記者劉志偉 通訊員余波)由我國(guó)科學(xué)家領(lǐng)銜的白菜、甘藍(lán)和油菜全基因組測(cè)序項(xiàng)目又取得階段性重大成果,完成了甘藍(lán)基因組測(cè)序和分析。該研究近日在線發(fā)表在國(guó)際權(quán)威學(xué)術(shù)期刊《自然·通訊》。
甘藍(lán)基因組測(cè)序是白菜、甘藍(lán)和油菜等蕓薹屬全基因組測(cè)序項(xiàng)目的一部分。這是繼白菜基因組測(cè)序項(xiàng)目后的又一重大成果。據(jù)甘藍(lán)項(xiàng)目組技術(shù)負(fù)責(zé)人、中國(guó)農(nóng)科院油料所劉勝毅研究員介紹,甘藍(lán)基因組至少包含45758個(gè)蛋白編碼基因,與白菜基因組相似,其基因組的大部分能夠與十字花科近緣模式植物擬南芥基因組建立共線性關(guān)系,進(jìn)而為基因組進(jìn)化研究提供了良好的模式材料。通過(guò)對(duì)這組模式材料的分析,科學(xué)家最終揭示出甘藍(lán)和白菜基因組間存在轉(zhuǎn)座子擴(kuò)增的不對(duì)稱性、串聯(lián)重復(fù)基因擴(kuò)增的不對(duì)稱性、可變剪切數(shù)量的不對(duì)稱性及共線性區(qū)外基因丟失率的不對(duì)稱性,而在種內(nèi)的亞基因組間存在基因丟失率差異以及亞基因組間同源基因的序列分化、表達(dá)分化、可變剪切分化等不對(duì)稱性進(jìn)化。該研究發(fā)現(xiàn)甘藍(lán)基因組擁有合成更多更廣抗癌類物質(zhì)的基因基礎(chǔ)。
油菜和甘藍(lán)基因組測(cè)序和分析項(xiàng)目總協(xié)調(diào)人、中國(guó)農(nóng)科院油料所王漢中研究員介紹,蕓薹屬作物基因組學(xué)研究成果對(duì)有效促進(jìn)油菜等蕓薹屬作物遺傳改良具有重要意義,如將使今后的蕓薹屬作物基因轉(zhuǎn)移變得有的放矢,使油菜的分子育種成為可能,尤其是克服油菜遺傳基礎(chǔ)狹窄等問(wèn)題。
該項(xiàng)成果是在中國(guó)農(nóng)科院油料所和蔬菜花卉所、華大基因研究院主導(dǎo)下,聯(lián)合多所國(guó)內(nèi)研究機(jī)構(gòu)以及美、澳、加、英、法、韓等國(guó)的相關(guān)研究機(jī)構(gòu)科研人員共同完成。