來源:《農(nóng)民日報》 作者:周錚
中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院日前在北京宣布,由14個國家29個單位的97名研究人員組成的“馬鈴薯基因組測序國際協(xié)作組”,繼2009年完成“馬鈴薯全基因組序列圖”后,經(jīng)過近兩年工作,馬鈴薯基因組研究又獲得重大成果??茖W(xué)家通過對馬鈴薯基因組生物學(xué)分析,初步揭示了馬鈴薯自交衰退的基因組學(xué)機(jī)制,發(fā)現(xiàn)了薯塊生長發(fā)育和病蟲害抗性的重要基因。這一研究成果為馬鈴薯的遺傳學(xué)研究及分子育種提供了非常有價值的資源。
7月14日,國際權(quán)威學(xué)術(shù)期刊《自然》發(fā)表了馬鈴薯全基因組序列圖和生物學(xué)分析的封面論文。在此成果中,由中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所、深圳華大基因研究院等組成的中國馬鈴薯基因組項目團(tuán)隊發(fā)揮了重要作用。中國作物學(xué)會馬鈴薯專業(yè)委員會主任委員屈冬玉博士是國際協(xié)作組的發(fā)起人和中方項目主持人,中方首席科學(xué)家、中國農(nóng)科院蔬菜所黃三文博士是論文3名通信作者之一,華大基因徐訊等年輕人組成的生物信息小組在項目中發(fā)揮了關(guān)鍵作用。在項目執(zhí)行過程中,中方團(tuán)隊實現(xiàn)了從參與到主導(dǎo)的跨越,奠定了中國在這一研究領(lǐng)域的國際領(lǐng)先地位。
2004年7月,由荷蘭瓦赫寧根大學(xué)EvertJacobsen教授、RichardVisser教授和屈冬玉博士共同發(fā)起籌劃成立了馬鈴薯基因組測序國際協(xié)作組,中方團(tuán)隊于2009年完成了單倍體馬鈴薯基因組的測序、拼接和注釋工作,并于當(dāng)年9月23日宣布馬鈴薯全基因組序列圖的完成。
近兩年來,在序列圖的基礎(chǔ)上,協(xié)作組對馬鈴薯基因組進(jìn)行了細(xì)致的生物學(xué)分析。分析結(jié)果表明:馬鈴薯基因組共包含約39031個基因,在進(jìn)化過程中經(jīng)歷了兩次全基因組復(fù)制。馬鈴薯是通過薯塊繁殖的,屬于營養(yǎng)繁殖作物,具有嚴(yán)重的自交衰退現(xiàn)象,對基因組的分析初步揭示了馬鈴薯自交衰退的基因組學(xué)機(jī)制。通過比較基因組分析,發(fā)現(xiàn)了薯塊生長發(fā)育和病蟲害抗性的重要基因。此外,馬鈴薯基因組也為進(jìn)一步了解雙子葉植物的進(jìn)化路徑提供了分子生物學(xué)新知識。
馬鈴薯是世界上第三大糧食作物,對于糧食安全的作用日益突顯。我國是世界最大的馬鈴薯生產(chǎn)國,目前面積已經(jīng)接近9000萬畝,總產(chǎn)量約900億公斤。然而,我國馬鈴薯單產(chǎn)水平剛到每畝1000公斤,只有先進(jìn)國家如荷蘭的1/3。缺乏適合于中國氣候條件和栽培方式的優(yōu)良品種已成為我國馬鈴薯產(chǎn)業(yè)發(fā)展的瓶頸,對于原產(chǎn)南美的馬鈴薯這一外來作物遺傳資源的研究和利用也特顯不足。
屈冬玉博士表示,在全基因組設(shè)計育種上,我國和荷蘭、美國等發(fā)達(dá)國家處于同一起跑線上。目前馬鈴薯全基因組遺傳變異圖譜的構(gòu)建和分子設(shè)計育種體系的開發(fā)是關(guān)鍵,亟須得到各方面的支持。同時他建議馬鈴薯基因組研究要加強(qiáng)與常規(guī)育種的結(jié)合,從而加速培育具有我國自主知識產(chǎn)權(quán)的馬鈴薯優(yōu)良品種。