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首款國(guó)產(chǎn)固相育種芯片“華麥芯65K”發(fā)布

放大字體  縮小字體 發(fā)布日期:2024-05-16  來(lái)源:農(nóng)民日?qǐng)?bào)·中國(guó)農(nóng)網(wǎng)  作者:龐斌雙 劉麗華 記者 蘆曉春  瀏覽次數(shù):336
 
  近日,國(guó)內(nèi)首款具備完全自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的高密度固相小麥育種芯片——“華麥芯”普通小麥基因分型65K芯片(簡(jiǎn)稱(chēng)“華麥芯65K”)發(fā)布,由北京市農(nóng)林科學(xué)院雜交小麥研究所種子檢測(cè)研究室(“北京小麥種子檢測(cè)中心”)牽頭聯(lián)合蘇州拉索生物芯片科技有限公司、中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)、西北農(nóng)林科技大學(xué)等單位研發(fā)。這一突破性品種對(duì)提升我國(guó)小麥品種創(chuàng)新、知識(shí)產(chǎn)權(quán)保護(hù)和種子質(zhì)量控制具有重要意義。
 
  據(jù)悉,“華麥芯65K”嚴(yán)格遵照《小麥品種真實(shí)性鑒定SNP標(biāo)記法》(NY/T4021-2021),囊括真實(shí)性鑒定和已知品種高密度指紋數(shù)據(jù)庫(kù)構(gòu)建的所有位點(diǎn),并整合轉(zhuǎn)基因檢測(cè)所必需的特定標(biāo)記物,以及部分與小麥產(chǎn)量、品質(zhì)、抗病等功能基因或緊密連鎖的SNP標(biāo)記。以中國(guó)春2.1版本為參考,目前包含54993個(gè)精選的SNP標(biāo)記(可根據(jù)未來(lái)研究重要結(jié)果擴(kuò)充至65K),覆蓋196個(gè)性狀相關(guān)標(biāo)記。SNP位點(diǎn)在A、B、D染色體上分布較均衡,多態(tài)性位點(diǎn)占比高達(dá)99.1%,具備良好的區(qū)分能力和穩(wěn)定性;單個(gè)SNP位點(diǎn)采用15~30個(gè)微球重復(fù)檢測(cè),平均檢出率高達(dá)99.0%,再現(xiàn)性高達(dá)99.5%。
 
  “華麥芯65K”具有五個(gè)突出優(yōu)勢(shì):一是全自主。從芯片制備到掃描儀、試劑、配套軟件及算法在內(nèi)的一體化解決方案均可自主實(shí)現(xiàn)。二是可擴(kuò)充。可根據(jù)需要在原有芯片基礎(chǔ)上隨時(shí)添加新的檢測(cè)位點(diǎn),無(wú)需重新定制新的芯片,靈活性高、可塑性強(qiáng)。三是多效用。該芯片集背景篩選、品種鑒定、轉(zhuǎn)基因檢測(cè)等多用途于一體,可實(shí)現(xiàn)一站式全面篩查,大幅提高檢測(cè)效率,并節(jié)約成本。四是低成本。固相芯片在規(guī)?;瘷z測(cè)時(shí)展現(xiàn)出顯著的成本效益。隨著樣本數(shù)量增加,單個(gè)樣本的檢測(cè)成本呈下降趨勢(shì),經(jīng)濟(jì)效益明顯。五是高效率。固相芯片以固態(tài)基底上的寡核苷酸探針為基礎(chǔ),無(wú)需依賴(lài)測(cè)序或其他基因分型技術(shù),即可一次性并行檢測(cè)數(shù)十萬(wàn)至數(shù)百萬(wàn)個(gè)SNP位點(diǎn),從檢測(cè)到數(shù)據(jù)分析,整個(gè)過(guò)程僅需72小時(shí),且準(zhǔn)確率保持在99%以上。24個(gè)樣本即可完成檢測(cè),無(wú)需湊樣。
 
  該芯片的成功研發(fā),有效解決了國(guó)外固相芯片技術(shù)壟斷“卡脖子”問(wèn)題,實(shí)現(xiàn)了我國(guó)高密度固相育種芯片從0到1的突破,將為我國(guó)小麥育種創(chuàng)新發(fā)展提供重要支撐。
 
 
 
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