近日,中國(guó)農(nóng)科院作物科學(xué)研究所水稻優(yōu)異種質(zhì)資源發(fā)掘與創(chuàng)新利用創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)在基因組層面解析我國(guó)黔東南香禾糯的遺傳演化規(guī)律及基因組印記,闡明侗族族源及遷徙路線(xiàn),為研究人類(lèi)文明和遷徙模式提供了一種新思路,并為未來(lái)高產(chǎn)和抗逆等水稻育種提供了有價(jià)值的基因組數(shù)據(jù)和資源。
研究團(tuán)隊(duì)利用香禾糯和長(zhǎng)江流域以南地方稻種,從基因組層面揭示香禾糯起源于廣西、廣東、福建和江西。結(jié)合民族學(xué)證據(jù)研究表明,后續(xù)香禾糯隨侗族祖先的遷徙而傳入黔東南。香禾糯與上述省份地方稻種之間存在顯著的基因滲入,預(yù)示著人類(lèi)活動(dòng)的干預(yù)。因此,該研究從基因組層面推測(cè)侗族族源來(lái)自廣西、廣東、福建和江西,同時(shí)從香禾糯的多次基因交流和滲入揭示侗族在歷史上發(fā)生了多次遷徙事件。
研究發(fā)現(xiàn),約350年前香禾糯與祖先群體發(fā)生遺傳分化,其有效群體規(guī)模約220-150年前達(dá)到頂峰;約150-120年前、30年前遭遇了馴化瓶頸,有效群體規(guī)模大幅下降,這分別與黔東南歷史上的“糯改粘”政策及雜交水稻大面積推廣事件相吻合。
此外,基因組印記揭示香禾糯農(nóng)藝性狀相關(guān)關(guān)鍵基因GS3、Hd1和DPS1以及耐冷相關(guān)關(guān)鍵基因LTG1和MYBS3是侗族選擇馴化的目標(biāo)基因,其單倍型變化模式為香禾糯馴化動(dòng)態(tài)過(guò)程提供了遺傳證據(jù)。該研究還發(fā)掘了一個(gè)穗粒數(shù)相關(guān)基因,可能對(duì)水稻增產(chǎn)發(fā)揮重要作用。
相關(guān)研究成果發(fā)表在《分子植物(Molecular Plant)》上,研究得到國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、國(guó)家自然科學(xué)基金、中國(guó)農(nóng)科院科技創(chuàng)新工程的支持。(通訊員 衛(wèi)斐)