豆科植物的根系不僅具有吸收運(yùn)輸養(yǎng)分、支持及貯存有機(jī)物質(zhì)的重要作用,而且還具有根瘤固氮的生態(tài)意義。近日,中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)研究所作物生物技術(shù)育種創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)與國(guó)內(nèi)其他科研單位合作,共同繪制完成首個(gè)豆科植物百脈根的根尖單細(xì)胞表達(dá)圖譜,鑒定出根尖的主要細(xì)胞類型,發(fā)現(xiàn)了新的細(xì)胞類型特異基因,并分析了各個(gè)細(xì)胞類型的潛在功能,對(duì)研究豆科植物根系發(fā)育、結(jié)瘤固氮以及生物育種具有重要意義。相關(guān)研究成果發(fā)表在《植物學(xué)報(bào)(Journal of Integrative Plant Biology)》上。
科研人員繪制出首個(gè)豆科植物根尖單細(xì)胞表達(dá)圖譜
近年來(lái),單細(xì)胞技術(shù)解析了模式植物擬南芥和作物水稻等根系的單細(xì)胞水平的基因表達(dá)圖譜,然而,豆科植物根系的細(xì)胞類型及其功能尚未解析。
研究首先對(duì)百脈根基因組進(jìn)行了組裝和注釋的提升。在此基礎(chǔ)上,對(duì)根尖解離出的22,688個(gè)原生質(zhì)體進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,得到了高質(zhì)量的測(cè)序結(jié)果,并通過(guò)新發(fā)現(xiàn)的細(xì)胞類型特異表達(dá)基因鑒定出了根尖的7種主要細(xì)胞類型,在國(guó)際上首次繪制了豆科植物百脈根的根尖單細(xì)胞表達(dá)圖譜。
科研人員進(jìn)一步分析了不同細(xì)胞類型的功能,發(fā)現(xiàn)9種激素和固氮相關(guān)基因在不同細(xì)胞類型的表達(dá)規(guī)律。另外,與擬南芥根尖單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組比較分析,進(jìn)一步表明了不同植物細(xì)胞類型的功能以及保守性和差異性。
該研究得到國(guó)家科技基礎(chǔ)資源調(diào)查專項(xiàng)、國(guó)家自然科學(xué)基金、重慶自然科學(xué)基金、中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技創(chuàng)新工程項(xiàng)目資助。