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西北農(nóng)林科技大學(xué)薛吉全團(tuán)隊利用多組學(xué)分析挖掘玉米籽粒含水量和脫水速率相關(guān)基因

放大字體  縮小字體 發(fā)布日期:2022-07-28  來源:The Crop Journal  作者:渠建洲  瀏覽次數(shù):1106
 
      玉米作為第一大糧食作物,是飼料、工業(yè)原料和能源的重要來源,對保障我國糧食安全和飼料安全具有重要的戰(zhàn)略意義。選育早熟耐密宜機收品種是實現(xiàn)生產(chǎn)方式由人工勞作向機械化生產(chǎn)轉(zhuǎn)型的關(guān)鍵,是玉米生產(chǎn)發(fā)展的必然趨勢。玉米收獲時籽粒含水率是影響機械化收獲的關(guān)鍵因素。目前玉米籽粒水分變化的遺傳調(diào)控機制尚不清楚,制約了宜機收玉米種質(zhì)創(chuàng)制和新品種培育。  
 
      近日,西北農(nóng)林科技大學(xué)薛吉全教授團(tuán)隊在The Crop Journal在線發(fā)表了題為Time-resolved multiomics analysis of the genetic regulation of maize kernel moisture的研究論文,通過時序多組學(xué)分析揭示了玉米籽粒水分動態(tài)變化的遺傳結(jié)構(gòu),篩選了與玉米籽粒含水率和脫水速率關(guān)聯(lián)的候選基因,為創(chuàng)制脫水快的玉米種質(zhì)和培育宜機收品種奠定良好的基礎(chǔ)。
      
 
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      該研究以團(tuán)隊自主構(gòu)建的陜A群和陜B群選育的玉米自交系為材料,明確了授粉后7、14、21、28、35、42、49、56、63和70天的玉米籽粒含水率動態(tài)變化規(guī)律,揭示了不同類型玉米自交系脫水速率差異特征。結(jié)合高通量高質(zhì)量SNP標(biāo)記、時序籽粒含水率和脫水速率數(shù)據(jù),以及表征籽粒含水率和脫水速率數(shù)據(jù)變化的主成分?jǐn)?shù)據(jù),在全基因組水平,分別鑒定到了98個和279個影響玉米籽粒含水率和脫水速率的SNP(圖1)。分析發(fā)現(xiàn),性狀關(guān)聯(lián)的SNP之間存在顯著的互作,且籽粒脫水速率關(guān)聯(lián)的SNP加性效應(yīng)大于籽粒含水率關(guān)聯(lián)的SNP加性效應(yīng)。同時,利用時序的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)和蛋白組數(shù)據(jù)構(gòu)建了玉米籽粒含水率相關(guān)基因和蛋白的共表達(dá)網(wǎng)絡(luò),明確了相關(guān)基因和蛋白顯著富集在淀粉合成、干燥等生物學(xué)過程(圖2)。多組學(xué)聯(lián)合分析鑒定的候選基因為進(jìn)一步解析玉米籽粒含水率和脫水速率的分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)提供了重要資源。


圖1  玉米籽粒含水率和脫水速率的全基因組關(guān)聯(lián)分析
      
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圖2  玉米籽粒含水率相關(guān)基因和蛋白及其功能多樣性
      
      作者和基金項目
      
      西北農(nóng)林科技大學(xué)玉米生物學(xué)與抗逆遺傳育種團(tuán)隊渠建洲博士為該文第一作者,薛吉全教授、馬闖教授和徐淑兔副教授為共同通信作者,碩士研究生茍曉楠、張浩、王孝月以及博士研究生程前等參加了部分?jǐn)?shù)據(jù)采集和分析工作。該研究得到陜西省自然科學(xué)基礎(chǔ)研究項目(S2021-JC-WT-006)、國家重點研發(fā)計劃“七大育種作物育種”專項(2018YFD0100200)、中國博士后科學(xué)基金(2018M633588)和國家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項(CARS-02-77)的資助。 
 
 
 
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