近期,河南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院植保所天敵組研究人員完成了吸漿蟲全基因組測(cè)序,并對(duì)其進(jìn)行了組裝和注釋。相關(guān)研究以“A chromosome-level genome assembly of the orange wheat blossom midge, Sitodiplosis mosellana Géhin (Diptera: Cecidomyiidae) provides insights into the evolution of a detoxification system”為題發(fā)表在G3-Genes Genomes Genetics雜志。
小麥吸漿蟲是我國小麥產(chǎn)區(qū)一種毀滅性害蟲,具有專性滯育的特性,成蟲發(fā)生期與小麥抽穗期高度吻合。一般受害麥田減產(chǎn)10%~30%,重者減產(chǎn)50%~70%,甚至造成絕收。本研究利用二代、三代及Hi-C輔助組裝相結(jié)合的測(cè)序策略,克服了吸漿蟲基因組的高雜合特性,組裝了連續(xù)性好、準(zhǔn)確度高的染色體水平基因組。在此基礎(chǔ)上通過與近緣物種進(jìn)行比較,闡述了吸漿蟲的基因組進(jìn)化、適應(yīng)性相關(guān)基因的收縮、擴(kuò)張等特征,為了解麥紅吸漿蟲的生物學(xué)、生態(tài)學(xué)和遺傳進(jìn)化機(jī)制,開發(fā)防治吸漿蟲的RNAi生物農(nóng)藥提供了豐富的基因資源。
該研究得到了國家小麥產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系、國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目的資助。