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古老棉種蓬蓬棉的基因組分化特征被揭示

放大字體  縮小字體 發(fā)布日期:2021-06-10  來(lái)源:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院棉花研究所  作者:何守樸  瀏覽次數(shù):332
 
  近日,中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院棉花研究所棉花資源創(chuàng)新利用創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)利用遺傳學(xué)和全基因組關(guān)聯(lián)分析等方法,系統(tǒng)地研究了一種在我國(guó)南方的多個(gè)海島生長(zhǎng)了數(shù)百年的陸地棉多年生半野生棉——蓬蓬棉,揭示了其進(jìn)化地位,為拓寬陸地棉遺傳多樣性提供了理論依據(jù)和材料基礎(chǔ)。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在《遺傳學(xué)與基因組學(xué)雜志(Journal of Genetics and Genomics)》上。
 
  據(jù)團(tuán)隊(duì)首席杜雄明研究員介紹,陸地棉是世界上栽培最廣的棉種。目前,公認(rèn)的7個(gè)陸地棉半野生棉均分布在中美洲地區(qū)。蓬蓬棉是多年生陸地棉半野生棉,常見(jiàn)于我國(guó)南方的多個(gè)海島,其在當(dāng)?shù)厮募径奸_(kāi)花,也被稱作“四季棉”。因蓬蓬棉種質(zhì)資源稀少而缺乏系統(tǒng)研究,其進(jìn)化地位也未得到確認(rèn)。自2010年起,在科技部基礎(chǔ)性工作專項(xiàng)等項(xiàng)目的大力支持下,團(tuán)隊(duì)經(jīng)多次實(shí)地考察,從我國(guó)廣東硇洲島和特呈島、海南島和西沙群島等地區(qū)共搜集蓬蓬棉種質(zhì)46份。
 
  該研究通過(guò)分析蓬蓬棉、中美洲半野生棉和現(xiàn)代栽培種群體的基因型發(fā)現(xiàn),蓬蓬棉是一個(gè)相對(duì)古老的陸地棉半野生棉,可能是數(shù)百年前地理大發(fā)現(xiàn)時(shí)代隨全球貿(mào)易商船或洋流運(yùn)動(dòng)傳入我國(guó)境內(nèi)。群體比較結(jié)果表明,蓬蓬棉基因組上攜帶一些特殊單體型區(qū)段,與中美洲陸地棉半野生棉和現(xiàn)代栽培種均存在差異,這些染色體區(qū)段對(duì)重新認(rèn)識(shí)陸地棉在我國(guó)的引進(jìn)和馴化歷史,進(jìn)一步拓展現(xiàn)代栽培陸地棉的遺傳多樣性具有重要意義。該研究還利用蓬蓬棉光周期敏感、纖維產(chǎn)量低和品質(zhì)差等特性,利用全基因組關(guān)聯(lián)分析方法鑒定到大量與開(kāi)花期、纖維產(chǎn)量和纖維品質(zhì)相關(guān)的SNP標(biāo)記,這些標(biāo)記所在的單體型區(qū)間為進(jìn)一步發(fā)掘相關(guān)性狀功能基因奠定了重要基礎(chǔ)。
 
  該研究得到了“十三五”國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃和農(nóng)業(yè)農(nóng)村部種質(zhì)資源保護(hù)專項(xiàng)等項(xiàng)目的資助。(通訊員 梁冰)
 
  原文鏈接:https://doi.org/10.1016/j.jgg.2021.04.009
 
 
 
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