由中國農(nóng)業(yè)科學院棉花研究所主持,深圳華大基因研究院、北京大學等單位共同完成的二倍體棉花-雷蒙德氏棉的全基因組草圖于8月26日發(fā)表在國際權(quán)威學術(shù)期刊《自然-遺傳學(Nature Genetics)》,標志著我國棉花基因組學研究取得了國際領(lǐng)先的地位。
棉花是全球最重要的經(jīng)濟作物之一,也是紡織工業(yè)主要的天然原料,還是一種研究多倍體化、細胞伸長和細胞壁生物合成極好的模式系統(tǒng)。目前,陸地棉占棉花種植面積的90%以上,而雷蒙德氏棉是陸地棉祖先的兩個供體種之一。為深入挖掘與利用棉花重要功能基因,加快分子育種和全基因組育種的進程,棉花所所長喻樹迅院士發(fā)起并主持實施了棉花基因組計劃(Cotton Genome Project,CGP)。研究團隊采用全基因組鳥槍法結(jié)合新一代的高通量DNA測序技術(shù)對雷蒙德氏棉進行了全基因組測序,獲得了其87.7%的全基因組序列。研究結(jié)果表明,雷蒙德氏棉是由其祖先歷經(jīng)多次基因組復制而形成的。
研究發(fā)現(xiàn),基因組包括了40976個蛋白質(zhì)編碼基因,其中,92.2%已得到了轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)的進一步證實。此外,科研人員還從基因組注釋結(jié)果中發(fā)現(xiàn)了有可能為早期纖維發(fā)育所必需的基因。
雷蒙德氏棉基因草圖的完成,為進一步解析陸地棉全基因組序列奠定了堅實的基礎,有利于棉花優(yōu)質(zhì)、高產(chǎn)、抗逆等重要農(nóng)藝性狀的深入研究,將進一步加快優(yōu)良新品種的培育進程。
農(nóng)業(yè)部副部長、中國農(nóng)業(yè)科學院院長李家洋特地發(fā)來賀信。他稱贊該項成果的取得為我國在世界棉花基因組學研究方面占得先機,希望研究人員繼續(xù)加強棉花基因組學研究,并將研究成果應用到培育優(yōu)良棉花品種上,最終實現(xiàn)基因組水平上的棉花分子設計育種,做到“頂天立地”。(通訊員 馮文娟)