20日，記者從中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院獲悉，該院鄭州果樹研究所草莓種質(zhì)改良團(tuán)隊聯(lián)合深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所共同發(fā)布八倍體草莓端粒到端?；蚪M，系統(tǒng)解析了八倍體草莓亞基因組結(jié)構(gòu)和遺傳分化，并解析了亞基因組的表觀遺傳進(jìn)化機制。相關(guān)成果日前發(fā)表于國際期刊《園藝研究》。

 

 

      紅顏草莓是我國主栽品種之一，其品質(zhì)優(yōu)良、豐產(chǎn)性強、商品性好，但對炭疽病、白粉病等抗性差，嚴(yán)重制約草莓產(chǎn)業(yè)的健康發(fā)展。

 

      論文通訊作者、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院鄭州果樹研究所研究員周厚成介紹，栽培草莓是復(fù)雜的八倍體植物。該研究以紅顏草莓為材料，從頭組裝八倍體草莓端粒到端粒基因組，鑒定出包含ABCD四個亞基因組共109320個基因。通過構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹，發(fā)現(xiàn)B、C和D亞基因組來源于同一祖先或祖先近緣種，C和D亞基因組最先被引入到八倍體基因組中，A亞基因組是最后的直接祖先供體。分析表明，A亞基因組CG、CHG和CHH甲基化水平最低。亞基因組A偏向表達(dá)基因高于其他亞基因組，且A偏向表達(dá)同源基因多為基因體甲基化。該研究為后續(xù)開展草莓基因功能挖掘、抗性分子育種和品質(zhì)改良提供了理論和數(shù)據(jù)支撐。

 

 

紅顏草莓T2T基因組和表觀遺傳。

 

      中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院鄭州果樹研究所助理研究員宋艷紅和深圳農(nóng)業(yè)基因組所博士后彭艷玲為論文共同第一作者，周厚成和中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組所研究員周永鋒為共同通訊作者。

 

      （中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院鄭州果樹研究所供圖）