近日,中國農業(yè)科學院鄭州果樹研究所甜瓜遺傳育種與栽培團隊聯(lián)合國內有關科研院校,對半野生型甜瓜“821”進行了高質量T2T基因組組裝,為揭示甜瓜抗性相關基因和品質改良提供了重要遺傳資源。相關研究成果發(fā)表在《園藝研究(Horticultural Research)》上。
甜瓜是一種重要的園藝經濟作物,其多樣性豐富。長期的人工選育致使一些相關性狀基因丟失,栽培品種的遺傳多樣性顯著少于野生種,在一定程度上限制了對甜瓜抗性基因及優(yōu)質性狀的發(fā)掘。
該研究首先完成了其單倍型T2T基因組的組裝,通過基因組比較發(fā)現(xiàn),在11號染色體存在基因拷貝數(shù)的變異,其中2個自噬基因與新德里病毒抗性顯著相關。此外,通過全基因組關聯(lián)分析,發(fā)現(xiàn)1個與果實成熟相關的顯著信號,并鑒定出候選基因CmABA2,其編碼一個細胞質短鏈脫氫酶,參與脫落酸的生物合成。該研究提供了高質量的半野生甜瓜基因組,為甜瓜抗性基因的挖掘和品質改良提供了遺傳資源。
該研究得到中國農業(yè)科學院科技創(chuàng)新工程、國家現(xiàn)代農業(yè)產業(yè)技術體系、海南省重點研發(fā)計劃等項目支持。(通訊員 趙倩)