近日,天津市農(nóng)科院蔬菜所花椰菜育種創(chuàng)新團隊與生物所農(nóng)業(yè)基因組學團隊合作在JCR Q1期刊《BMC Plant Biology》(影響因子5.26)在線發(fā)表了題為“Construction of an SNP fingerprinting database and population genetic analysis of 329 cauliflower cultivars”的研究論文。該論文首次報道了基于高通量測序技術(shù)構(gòu)建花椰菜SNP指紋圖譜的工作。
中國是花椰菜產(chǎn)銷量第一大國,種業(yè)市場品牌侵權(quán)事件時有發(fā)生,嚴重影響了育種單位的利益以及花椰菜種業(yè)的健康發(fā)展,通過構(gòu)建分子標記指紋圖譜實現(xiàn)品種的快速、精準鑒別,是解決這一問題的重要途徑。該研究從實驗室前期建立的花椰菜SNP分子標記數(shù)據(jù)庫中,篩選獲得1662個高質(zhì)量SNP位點,結(jié)合核心種質(zhì)資源集與數(shù)字模擬技術(shù)推斷最優(yōu)組合,最終成功優(yōu)選出41個具有高度多態(tài)性的SNP分子標記。在329份花椰菜品種中進行的KASP實驗驗證與指紋圖譜構(gòu)建結(jié)果顯示,這些SNP標記能夠精準、高效的實現(xiàn)品系鑒定,并且群體結(jié)構(gòu)分析結(jié)果發(fā)現(xiàn)花椰菜群體與花球松緊度以及地理起源顯著相關(guān)。該指紋圖譜的成功構(gòu)建為花椰菜品種真實性和純度鑒定提供了重要工具,同時為加速花椰菜分子育種進程提供了重要技術(shù)支撐。
天津市農(nóng)科院與南開大學聯(lián)培碩士研究生楊禹堯、市農(nóng)科院種質(zhì)資源與生物技術(shù)研究所呂明杰博士為該論文的共同第一作者。市農(nóng)科院蔬菜研究所姚星偉研究員、市農(nóng)科院種質(zhì)資源與生物技術(shù)研究所楊迎霞助理研究員為該論文的共同通訊作者。該項目得到“131”花椰菜育種創(chuàng)新團隊建設、現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系、天津市蔬菜產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系創(chuàng)新團隊和市農(nóng)科院院長基金等項目的支持。