12月31日,由中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院棉花研究所生物信息與分子設(shè)計(jì)中心構(gòu)建的棉花資源和網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫(kù)網(wǎng)站(http://grand.cricaas.com.cn)正式上線。用戶可在該網(wǎng)站上進(jìn)行數(shù)據(jù)挖掘和分析、可視化展示等,操作簡(jiǎn)單快捷,結(jié)果準(zhǔn)確易懂。
該數(shù)據(jù)庫(kù)網(wǎng)站(Gossypium Resource And Network Database,GRAND)目前主要功能有:棉花SNP變異和Indel變異,基因組注釋信息以及基因家族信息的可視化瀏覽、多重標(biāo)準(zhǔn)檢索,比較檢索,基因檢索,Marker檢索以及表型性狀檢索等多種檢索功能、引物設(shè)計(jì)、表達(dá)譜展示、數(shù)據(jù)下載與上傳等。目前該數(shù)據(jù)庫(kù)只是第一版本,后續(xù)將開發(fā)更多功能。
近年來,棉花所先后完成了二倍體雷蒙德氏棉(D基因組)、二倍體亞洲棉(A基因組)及四倍體陸地棉(A/D組)全基因組測(cè)序及圖譜繪制工作,在棉花基因組測(cè)序領(lǐng)域占據(jù)國(guó)際領(lǐng)先地位。GRAND數(shù)據(jù)庫(kù)網(wǎng)站整合和挖掘了棉花所完成的棉花全基因組測(cè)序數(shù)據(jù)及其他相關(guān)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),并向全球開放,為棉花科研人員提供了便利,將極大地促進(jìn)棉花分子育種以及棉花其他分子生物學(xué)方面的研究,提升棉花所在全球的科研地位和影響力。(通訊員 梁冰)